Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms