Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms