Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms