Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCAO15360 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCAO15360 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCAO15360 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCAO15360 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCAO15360 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCAO15360 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
FANCAO15360 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms