Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F3O00716 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F3O00716 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F3O00716 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F3O00716 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms