Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRPO00591 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRPO00591 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRPO00591 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms