Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3KR12 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3KR12 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KR12 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KR12 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3KR12 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3KR12 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3KR12 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KR12 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms