Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1BA8MQ27 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1BA8MQ27 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms