Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM90A7PA6NKC0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms