Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C9orf92A6NGG3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C9orf92A6NGG3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms