Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms