Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A4Q9Y6R1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms