Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms