Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3M1Q9Y2T2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms