Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCQ9Y266 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCQ9Y266 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms