Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC5Q9UQL6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC5Q9UQL6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms