Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS5Q9UPZ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms