Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms