Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms