Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms