Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCDC2Q9UHG0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCDC2Q9UHG0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms