Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH3Q9UHC1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH3Q9UHC1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms