Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLKQ9UBT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms