Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC17A6Q9P2U8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms