Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHPF2Q9P2E5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHPF2Q9P2E5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms