Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms