Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC180Q9P1Z9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms