Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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