Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWV8

BABAM1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BABAM1Q9NWV8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BABAM1Q9NWV8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BABAM1Q9NWV8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms