Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL1Q9NSC2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms