Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms