Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms