Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNDIG1Q9H7V2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNDIG1Q9H7V2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms