Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms