Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM4Q9C037 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms