Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms