Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL6Q9BWW8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms