Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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