Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNDC11Q9BVV2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms