Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCMBPQ9BTE3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms