Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CRACR2AQ9BSW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms