Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF1Q9BSM1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms