Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms