Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms