Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms