Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CELF6Q96J87 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms