Protein–RNA interactions for Protein: Q96HT8

MRFAP1L1, MORF4 family-associated protein 1-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRFAP1L1Q96HT8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRFAP1L1Q96HT8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRFAP1L1Q96HT8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms