Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms