Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RSPRY1Q96DX4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RSPRY1Q96DX4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RSPRY1Q96DX4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSPRY1Q96DX4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSPRY1Q96DX4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSPRY1Q96DX4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSPRY1Q96DX4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms