Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX29Q8TEQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms